Заведующий лабораторией — Боголюбова-Кузнецова Аполлинария Васильевна, кандидат биологических наук.
Лаборатория трансплантационной иммунологии входит в состав управления биомедицинских технологий. Основана в ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России в 2015 г. Основная научная проблематика исследований — разработка методов профилактики и терапии гематологических заболеваний на основе Т-лимфоцитов, выявление особенностей Т-клеточного иммунного ответа на различные патогены, включая вирус SARS-CoV-2.
ТЕМЫ ИССЛЕДОВАНИЙ ЛАБОРАТОРИИ СЕГОДНЯ
Разработка CAR-T-клеточных препаратов для терапии злокачественных новообразований крови
Сравнительно новый метод лечения опухолей кроветворной системы – использование лимфоцитов с химерным антигенным рецептором, специфичным к опухолевому антигену, — CAR-T.
Сотрудники лаборатории разрабатывают оригинальный анти-CD19 CAR-T-клеточный лекарственный препарат для лечения В-клеточных злокачественных новообразований. Кроме того, ведутся исследования по созданию «универсальной» CAR-T-клеточной платформы, с помощью которой можно получить CAR-T-клетки, специфичные к заданному антигену человека.
Изучение Т-клеточного ответа на вирус SARS-CoV-2
Для создания диагностических систем и вакцин против коронавируса необходимы исследования взаимодействий иммунитета человека с вирусом.
Сотрудники лаборатории ищут новые участки (эпитопы) вируса, на которые формируется иммунный ответ и иммунологическая память, а также изучают Т-клеточный иммунитет у пациентов, перенесших COVID-19, не болевших COVID-19 людей и вакцинированных против SARS-CoV-2.
Публикации:
- SARS-CoV-2 epitopes are recognized by a public and diverse repertoire of human T cell receptors. A. Shomuradova, M. Vagida, S. Sheetikov, K. Zornikova, D. Kiryukhin, A. Titov, I. Peshkova, A. Khmelevskaya, D. Dianov, M. Malasheva, A. Shmelev, Y. Serdyuk, D. Bagaev, A. Pivnyuk, D. Shcherbinin, A. Maleeva, N. Shakirova, A. Pilunov, D. Malko, E. Khamaganova, B. Biderman, A. Ivanov, M. Shugay, G. Efimov. Immunity (Dec 2020) doi.org/10.1016/j.immuni.2020.11.004;
- Longitudinal high-throughput TCR repertoire profiling reveals the dynamics of T cell memory formation after mild COVID-19 infection. A. Minervina, E. Komech, A. Titov, M. Koraichi, E. Rosati, I. Mamedov, A. Franke, G. Efimov, D. Chudakov, T. Mora, A. Walczak, Y. Lebedev, M. Pogorelyy arXiv:2005.08290v3.
· Minervina AA, Komech EA, Titov A, Bensouda Koraichi M, Rosati E, Mamedov IZ, Franke A, Efimov GA, Chudakov DM, Mora T, Walczak AM, Lebedev YB, Pogorelyy MV. Longitudinal high-throughput TCR repertoire profiling reveals the dynamics of T-cell memory formation after mild COVID-19 infection. Elife. 2021 Jan 5;10:e63502. doi: 10.7554/eLife.63502. PMID: 33399535; PMCID: PMC7806265.
· Goncharov M, Bagaev D, Shcherbinin D, Zvyagin I, Bolotin D, Thomas PG, Minervina AA, Pogorelyy MV, Ladell K, McLaren JE, Price DA, Nguyen THO, Rowntree LC, Clemens EB, Kedzierska K, Dolton G, Rius CR, Sewell A, Samir J, Luciani F, Zornikova KV, Khmelevskaya AA, Sheetikov SA, Efimov GA, Chudakov D, Shugay M. VDJdb in the pandemic era: a compendium of T cell receptors specific for SARS-CoV-2. Nat Methods. 2022 Sep;19(9):1017-1019. doi: 10.1038/s41592-022-01578-0. PMID: 35970936.
· Titov A, Shaykhutdinova R, Shcherbakova OV, Serdyuk YV, Sheetikov SA, Zornikova KV, Maleeva AV, Khmelevskaya A, Dianov DV, Shakirova NT, Malko DB, Shkurnikov M, Nersisyan S, Tonevitsky A, Khamaganova E, Ershov AV, Osipova EY, Nikolaev RV, Pershin DE, Vedmedskia VA, Maschan M, Ginanova VR, Efimov GA. Immunogenic epitope panel for accurate detection of non-cross-reactive T cell response to SARS-CoV-2. JCI Insight. 2022 May 9;7(9):e157699. doi: 10.1172/jci.insight.157699. PMID: 35389886; PMCID: PMC9090254.
· Wu D, Kolesnikov A, Yin R, Guest JD, Gowthaman R, Shmelev A, Serdyuk Y, Dianov DV, Efimov GA, Pierce BG, Mariuzza RA. Structural assessment of HLA-A2-restricted SARS-CoV-2 spike epitopes recognized by public and private T-cell receptors. Nat Commun. 2022 Jan 10;13(1):19. doi: 10.1038/s41467-021-27669-8. PMID: 35013235; PMCID: PMC8748687.
· Molodtsov IA, Kegeles E, Mitin AN, Mityaeva O, Musatova OE, Panova AE, Pashenkov MV, Peshkova IO, Alsalloum A, Asaad W, Budikhina AS, Deryabin AS, Dolzhikova IV, Filimonova IN, Gracheva AN, Ivanova OI, Kizilova A, Komogorova VV, Komova A, Kompantseva NI, Kucheryavykh E, Lagutkin DА, Lomakin YA, Maleeva AV, Maryukhnich EV, Mohammad A, Murugin VV, Murugina NE, Navoikova A, Nikonova MF, Ovchinnikova LA, Panarina Y, Pinegina NV, Potashnikova DM, Romanova EV, Saidova AA, Sakr N, Samoilova AG, Serdyuk Y, Shakirova NT, Sharova NI, Sheetikov SA, Shemetova AF, Shevkova LV, Shpektor AV, Trufanova A, Tvorogova AV, Ukrainskaya VM, Vinokurov AS, Vorobyeva DA, Zornikova KV, Efimov GA, Khaitov MR, Kofiadi IA, Komissarov AA, Logunov DY, Naigovzina NB, Rubtsov YP, Vasilyeva IA, Volchkov P, Vasilieva E. Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2)-Specific T Cells and Antibodies in Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Protection: A Prospective Study. Clin Infect Dis. 2022 Aug 24;75(1):e1-e9. doi: 10.1093/cid/ciac278. PMID: 35435222; PMCID: PMC9047235.
Изучение иммунного ответа на минорные антигены гистосовместимости и создание метода Т-клеточной терапии лейкозов
Наиболее тяжелым побочным эффектом трансплантации является реакция «трансплантат против хозяина». Она может возникнуть даже при полной совместимости донора и пациента по HLA (антигены лейкоцитов человека), поскольку клетки донора могут реагировать на минорные антигены гистосовместимости (МАГ) в организме пациента, они другие из-за генетических различий разных людей.
В лаборатории ищут МАГ, которые наиболее часто вызывают иммунный ответ при трансплантации, и изучают параметры иммунного ответа у пациентов после трансплантации. Исследование направлено на более успешный подбор пар донор—пациент при трансплантации клеток крови.
Иммунная реакция на МАГ может иметь и терапевтическое применение. Так, сотрудники лаборатории используют антиген НА-1 на поверхности клеток крови как мишень в разрабатываемом подходе терапии лейкозов. Внедрение в Т-лимфоциты донора рецептора, который распознает НА-1, позволит им узнавать и уничтожать остаточные лейкозные клетки, выжившие после химиотерапии и трансплантации, что должно снизить риск развития рецидива.
Публикации:
- Rapid Multiplex Genotyping of 20 HLA-A*02:01 Restricted Minor Histocompatibility Antigens. D. Romaniuk, A. Postovskaya, A. Khmelevskaya, D. Malko, G. Efimov. Frontiers in Immunology (Jun 2019) 10: 1226 frontiersin.org/articles/10.3389/fimmu.2019.01226/full;
- In Silico Analysis of the Minor Histocompatibility Antigen Landscape Based on the 1000 Genomes Project. N. Bykova, D. Malko, G. Efimov. Frontiers in Immunology (Aug 2018) 9: 1819 frontiersin.org/articles/10.3389/fimmu.2018.01819/full;
- Transgenic lymphocytes targeting minor histocompatibility antigens for post-transplant immunotherapy. A. Pilunov, D. Romaniuk, S. Sheetikov, A. Khmelevskaya, A. Shmelev, N. Bykova, A. Shomuradova, D. Kiryukhin, D. Dianov, G. Efimov. Cytotherapy (May 2020) 22: 5 (Supplement), S124 sciencedirect.com/science/article/pii/S1465324920302978;
- Development of T-Cell Therapy Targeting Hematopoietic Minor Histocompatibility Antigen HA-1. A. Pilunov, D. Romaniuk, S. Sheetikov, A. Khmelevskaya, A. Shmelev, N. Bykova, A. Shomuradova, D. Kiryukhin, D. Dianov, G. Efimov, V. Savchenko. Blood (Nov 2019) 134 (Supplement 1): 5749 doi.org/10.1182/blood-2019-130552.
Создание Т-клеточной вакцины против цитомегаловирусной инфекции
В ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России проходит клиническая апробация метода Т-клеточной терапии цитомегаловирусной (ЦМВ) инфекции у пациентов после переливания стволовых клеток крови донора. Цель терапии — снизить риск отторжения трансплантата. Для этого используется особая популяция иммунных клеток донора, которые узнают и уничтожают заражённые цитомегаловирусом клетки. Такой подход называется «Т-клеточная вакцина», потому что введённые пациенту Т-клетки обеспечивают иммунный ответ на инфекцию.
Сотрудники лаборатории изучают Т-клеточный ответ на ЦМВ у здоровых доноров и пациентов после трансплантации стволовых клеток крови. В лаборатории был разработан алгоритм подбора пар донор—пациент для введения пациенту Т-клеток донора против ЦМВ, этот алгоритм применяется в клинической апробации. Т-клетки для терапии получают по международному стандарту Надлежащей производственной практики (GMP).
Публикации:
- Abundance, diversity and functionality of cytomegalovirus-specific T cells depends on HLA genotype of the donor and hierarchy of the immunodominant epitopes. A. Maleeva, K. Zornikova, D. Kiryukhin, N. Shakirova, V. Shmarov and G. Efimov. The Journal of Immunology (May 2020) 204 (Supplement 1): 94.13 jimmunol.org/content/204/1_Supplement/94.13;
- Repertoire of Cytomegalovirus-Specific T Cells Is Focused on the Immunodominant Epitopes in Fixed Hierarchy Dependent on HLA Genotype of the Donor. A. Maleeva, V. Shmarov, D. Kiryukhin, G. Efimov, V. Savchenko. Blood (Nov 2019) 134 (Supplement 1): 2327 doi.org/10.1182/blood-2019-130241;
- CMV-specific T-cell reconstitution as a key factor for identification of candidates for CMV-specific lymphocytes infusion. A. Dmitrova, V. Shmarov, M. Drokov, L. Kuzmina, N. Popova, E. Mikhaltsova, V. Vasilyeva, M. Dovyidenko, O. Koroleva, D. Dubnyak, Z. Konova, E. Usikova, U. Maslikova, O. Starikova, D. Kiryukhin, G. Efimov, E. Parovichnikova, V. Savchenko. HemaSphere (Jun 2019) 3: S1, p 1037 doi:10.1097/01.HS9.0000567776.14469.6f.
