Заведующий отделением — врач-гематолог — Кузьмина Лариса Анатольевна, кандидат медицинских наук.
Гематологическая клиника Института переливания крови была создана в 1927 г. по инициативе профессоров М. П. Кончаловского, Х. Х. Владоса.
В 1969—1988 гг. руководителем гематологической клиники был заслуженный деятель науки РСФСР, участник ВОВ, профессор Ф. Э. Файнштейн. Под его руководством продолжались работы по изучению лейкозов, лимфом, апластической анемии, гемолитических анемий; совершенствовались протоколы лечения этих заболеваний; разрабатывались программы лечения лейкозов, апластической анемии, включающие трансплантацию костного мозга. Ф. Э. Файнштейн один из авторов монографий «Болезни системы крови» (1980, 1987), «Депрессии кроветворения» (1987).
В 1972 г. в клинике был открыт первый блок трансплантации на 8 коек, где под руководством Любимовой Л. С. в 1972—74 гг. проведены первые исследования по лечению пациентов апластической анемией с внутривенным введением аллогенного костного мозга с использованием антилимфоцитарного глобулина, в 1977 г. Любимовой Л. С., Менделеевой Л. П. выполнена первая трансплантация аллогенного костного мозга у пациента с острым лимфобластным лейкозом с кондиционированием высокими дозами циклофосфана.
С 1988 по 2011 гг. отдел возглавлял академик РАМН, проф. В. Г. Савченко, а с 2011 по 2021 г. — д. м. н. Е. Н. Паровичникова. За это время в отделе проведено более 1300 трансплантаций гемопоэтических стволовых клеток.
Отделение было открыто в апреле 1989 г. В настоящее время в отделении выполняется более 120 аллогенных трансплантаций в год у пациентов с различными формами гемобластозов, в основном с острыми лейкозами, в том числе от неродственных, частично совместимых, гаплоидентичных доноров гемопоэтических стволовых клеток. В феврале 2014 г. в отделении была выполнена первая трансплантация от неродственного донора из России.
С этого момента сотрудники отделения проводят большую работу для создания Регистра неродственных доноров в Российской Федерации, участвуют в создании нормативных актов для улучшения правового регулирования в данной области.
Основные научные задачи отделения — внедрение различных режимов предтрансплантационного кондиционирования, а также схем иммуносупрессии после трансплантации костного мозга, обеспечение современного уровня ведения больных в условиях глубокого и длительного агранулоцитоза и иммунодепрессии, прогнозирование неприживления трансплантата, разработка способов его терапии, лечение геморрагического синдрома и токсических осложнений в посттрансплантационном периоде, разработка новых методов лечения и профилактики острой и хронической реакции «трансплантат против хозяина», а также терапии рецидивов гемобластозов после трансплантации гемопоэтических стволовых клеток. Сотрудники отделения также работают в различных научных лабораториях центра, где проводятся различные фундаментальные исследования. В течение года по темам научно-клинических работ публикуется около 20—30 печатных работ. Ежегодно к защите представляется 1—2 диссертации.
Сотрудники отделения участвуют во всех конференциях «Лейкозы и лимфомы. Терапия и фундаментальные исследования», проводимых ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России, принимают участие в ежегодных международных и отечественных конференциях по трансплантации стволовых гемопоэтических клеток, являются организаторами-экспертами и участниками российских научных конференций по гематологии и трансплантации костного мозга.
Сотрудники отделения регулярно проводят школы пациентов, что необходимо для улучшения результатов лечения и качества жизни тех больных, которые перенесли трансплантацию аллогенных гемопоэтических стволовых клеток.